草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿控制系统最经比较常见的患病一个。肾聚集中CaOx氯化钠晶体过供大于求基性岩会导至肾小管人体细胞断裂和凋亡，为了导至肾结石的组成。短链人体皮脂酸由直肠内活性污泥法螨虫酵营养膳食人造纤维行成，不禁在位置直肠防御系统中树立效果，同时还在控制系统水平面上也树立要点效果。之中，丁酸是最大量的短链人体皮脂酸，具消除炎症和免疫检测减缓效果,本调查探究丁酸对CaOx肾结石的效果基本意向靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山医院口腔科泌尿普外吴忠博士后生导师、周子健博士后于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠讲解、周子健研究生在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物制品与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了线上临床药理学服务于，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

篇文章分类：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 雇主行业：华山机构 科研对方：大鼠、HK-2神经细胞 组群内容：比较组（Con）、模型工具组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱提供了科技：网络信息药理学学检侧

要点的流程

调查结杲

理论研究分析者应先创建大鼠模式，根据生物学什么是生化标准和阻止疾病学固色等理论研究分析的手段发觉丁酸都可以削减CaOx模式大鼠肾CaOx尖晶石的达成和伤到，减少CaOx模式大鼠的真菌感染伤到和钝化类物质的神经太过紧绷表述。不但，丁酸还可可以抑制草酸诱惑的HK-2受损细胞系伤到、钝化应激反应和受损细胞系凋亡。 为探求丁酸型式和靶什么是遗传表观遗传遗传遗传互联网信息，探讨人从PubChem查看丁酸和丁酸酯的二维和三维立体型式（图1A）。根据PharmMapper数值文件库和Uniprot数值文件库治理 后共筛分出119个丁酸靶什么是遗传表观遗传遗传遗传供进步骤剖析。将什么是遗传表观遗传遗传遗传文件列表导成STRING数值文件库，确定PPI互联网信息剖析。Cytoscape写出了筛选的前20的联络线靶什么是遗传表观遗传遗传遗传的详解互联网信息图，涉及CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。许多联络线什么是遗传表观遗传遗传遗传与互联网信息中的其它什么是遗传表观遗传遗传遗传均表演出固定的关以于性，原因具体分析许多什么是遗传表观遗传遗传遗传机会性产生着协同工作功效。GO和KEGG剖析折射出了丁酸联络线什么是遗传表观遗传遗传遗传的关以于手段和生物工程工程学的功能（图1C）。联络线什么是遗传表观遗传遗传遗传通常与类固醇生长生长激素回复、防脱色应激状态状态回复、活力氧细胞核对类固醇生长生长激素的刺激的反响及其对强酸化学上的有机物的反响关以。与此同时阐明，许多联络线什么是遗传表观遗传遗传遗传通常进入了防脱色应激状态状态和对活力氧的生物工程工程反响进程，是肾结石产生长效机制中至关核心的手段，这是因为丁酸机会性在肾结石中产生核心功效。

图1| 丁酸组成部分与靶dna微信网络阐述(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进一点探求丁酸对CaOx肾结石确凿切靶dna，设计考生展开GEO统计资料库对GSE73680中安全参考与CaOx肾结石病员的dna差异性展开了设计。参考组与CaOx结石病员的特殊能力差异性传达方法dna（DEGs）肿瘤筛查规范为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共需求到3783个dna的发生特殊变迁，里面3379个（89.4%）dna传达方法上涨，404个（10.6%）dna传达方法下降（图2A）。对DEGs展开聚类分析法分析一下分析一下，热图表明了前10个被选中DEGs的二维上下分层聚类分析法分析一下显著特点（图2B）。马上又，设计考生顺利通过GeneCards统计资料库人工控制检测了370个能够与CaOx肾结石有关的dna，名次前20位的预估dna极其有关性评级长为2C所显示。为了能遇到丁酸治疗方法CaOx肾结石的根本靶点，设计考生将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关dna除理能够打了个个Venn图。终于，CYP2C9被制定为丁酸应响CaOx肾结石的潜在的靶点(图2D)。不仅，设计考生还展开了丁酸与CYP2C9的分子式接管，CYP2C9的三种氨基残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸彼此之间功能，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在利用手机网络药剂学学予测CYP2C9是丁酸会影响CaOx肾结石的靶表观遗传后，的研究人士还借助細胞调查核实了CYP2C9可变低草酸帮助的HK-2細胞的ROS层次、疾病伤害和凋亡。

图2| 很多据库联动分享预測CYP2C9是丁酸的作用于CaOx肾结石的靶人类基因

理论研究结论

本研发一方面感觉丁酸在身体之外和内部均能调控CaOx肾结石绘图的阳极氧化反应应激反应状态和慢性支原体感染伤害，接着借助无线网上药学学筛分受到丁酸损害CaOx肾结石的自身靶点——CYP2C9，另外借助体細胞进行实验验证CYP2C9在草酸盐诱骗的HK-2体細胞ROS总体水平、慢性支原体感染伤害和凋亡。哪些感觉表示丁酸机会借助调控CYP2C9来调控CaOx肾结石的阳极氧化反应应激反应状态，消除慢性支原体感染伤害。这一个整个过程中拜谱生物制品枝术出具了无线网上药学学枝术业务，还有拜谱生物制品枝术可延长进一步优化进一步优化的dna组学、球核苷酸组学、分解代谢组学等几组学成品及枝术业务，祝贺转达网络咨询！ 学习论文：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.