
近日,北京医科综合大学第一个复属卫生院王学浩中科院院士团队合作在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,淀粉酶互作组和靶向治疗能量转换新陈代谢检测分析服务。
英语翻译网站标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
英文版标题格式:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
消费者院校:南京医科大学
研究方案原材料:细胞
拜谱展示 业务:转录组测序+球蛋白互作组+靶向药物势能排泄组
的技术的路线:
的研究然而
01、YBX1被司法鉴定为HCC中糖酵解的最为关键的dna
本探究采集工具HCC良性肿癌子样本(n=7)的单神经元RNA测序参数集展开研究定性分折,发掘糖酵解活力主耍密集在良性肿癌神经元中,hdWGCNA研究定性分折设别出9个什么是基因功能(图1A-G)。TCGA-LIHC链表的发展研究定性分折判别YBX1为独特发展风险点环境因素(图1H)。进每一步紧密结合IHC、WB调查和良性肿癌公司与挨近非良性肿癌公司的环境空间转录组学参数集确认YBX1是肝神经元癌治療的未知靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被确定好为调准HCC生殖细胞糖酵解的关键的客观因素
02、YBX1可以淡化HCC中的有氧糖酵解和繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向疗法能源代谢率组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1有助于HCC中的有氧糖酵解和增值能力
03、OGT与YBX1组合并促使YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,核蛋白互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1切合并驱动YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化怎强其磷过酸,而使使得其核转位
进一大步论文检测YBX1的O-GlcNAc糖基化需不需要作用其磷硝化作用,在OGT敲低的HCC神经细胞膜中或用OGT可以抑剂型OSMI-1治疗,YBX1血清水准明显减小,YBX1磷硝化作用明显增多(图4A-C)。IP实验性显示信息,在类似的Flag-YBX1底物水准下,YBX1-WT的磷硝化作用水准明显高出YBX1-T57A,揭示磷硝化作用的上升不但仅是可能比较高的YBX1血清表述(图4D)。溶合了核和质混合物发掘TMG治疗的HCC神经细胞膜中YBX1核表述的增加(图4E-F),进一大步发掘YBX1磷硝化作用的重中之重控制成分是AKT(图4G-I)。这一些发掘讲求O-GlcNAc糖基化确认提高其磷硝化作用来提高YBX1血清保持稳相关性并提高核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 突显有助于其进的一步引发磷硝化作用突显并要驱动其核转位
05、YBX1催进PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1推进PKM2转录
06、YBX1 是可以的提升组蛋白质乳过酸体现水准
研究方案看到YBX1敲低偏态消减淀粉酶质乳硝化成用,愈加是H3K18乳硝化成用(图6A-C)。糖酵解减弱剂2-DG的调查可确认了糖酵解与组淀粉酶乳硝化成用的随便同步,减弱糖酵解可偏态消减H3K18la平均水平(图6D)。PKM2过表答可逆反应转YBX1敲低可致的H3K18la上升,到外源乳酸处里仅仅上升H3K18la,还跟随YBX1表答上浮,表示有同向评价(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR可确认,H3K18la经由含有于YBX1开机启动子随便推进其转录,该时候受O-GlcNAc糖基化改善(图6H-J),并看到P300 上浮是YBX1改善H3K18乳酰化成用的共识机制(图6K-L)。
图6.YBX1减弱H3K18乳过酸绘制品质
经典文章总结ppt
在某项研究探讨中报到了YBX1在HCC中高把你想表达出来出来,而与糖酵解密码切对应。YBX1在T57处被O-GlcNAc掩盖,而动态平衡淀粉酶质并加剧其把你想表达出来出来。在这种掩盖还有利于开展YBX1在T57处的磷过酸,有利于开展其核易位。所以说,相应具体步骤开展了糖酵解对应DNA遗传的转录并兴奋乳酸的形成。于此,YBX1促活P300的转录,继而驱动程序组淀粉酶的乳过酸,尤其是H3K18la,H3K18乳过酸朝政策调控YBX1DNA遗传转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观隔代遗传正反两面馈环缘由图
拜谱个人心得体会
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱动物为该研究提供了转录组测序,球蛋白互作组和靶向疗法消耗的能量代谢转化组技术服务,拜谱生物学建立了完善成熟的转录组学、蛋清组学、译文资料后表达组学、代谢转化组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
决定性文献
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.