
2024年9月由常州农耕大学专业张万刚专家教授管理团队在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱怪物为该研究提供了亚硝基化淡化组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
英文版网站标题:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
期刊杂志:Journal of Agricultural and Food Chemistry
2025年影晌指数:5.7
发过期限:2024年9月
朋友机关单位:南京农业大学
学习建材:蛋白
拜谱可以提供系统:亚硝基化修饰组学
工艺自驾路线:
一、论述结果显示
01.Caspase-3化学活化
如今尚不了解清楚NO对caspase-3的限生产制意义有没归因于NO介导的S-亚硝基化,有所不同氧化还原电位系数的GSNO充当外源性NO批售,以帮助caspase-3的体内S-亚硝基化。结论认为,与没GSNO的组相较于,100、200和400μM GSNO组的caspase-3几丁质酶相关性下降(图1),与前者宣传报道不一。GSNO办理下降caspase-3几丁质酶的内在的原因分析仍存在不足阐发。
图1 不同于氧化还原电位的GSNO操作对caspase-3活性酶类的关系
02.Caspase-3的S-亚硝基化程度上
论述Caspase-3的亚硝基化状态,以说明GSNO对Caspase-3的化学反应性。经GSNO办理后,探测到caspase-3血清S-亚硝基化的强度增大(图2)。这部分可是取决于,外源性GSNO激发可胜利诱惑caspase-3的休外S-亚硝基化。另人大吃一惊的是,在都没有GSNO具备的相较比较组中探测到这个绚烂的S-亚硝基化带,这取决于caspase-3很有可能形成内源性的S-亚硝基化。虽然,本论述中caspase-3的S-亚硝基化状态较高,而caspase-3的渗透性大幅度降低,这与此前的论述一致性。只不过,caspase-3的特女性朋友S-亚硝基化遮盖位点尚不模糊,还须要进十步的挑战。
图2 GSNO办理对caspase-3S-亚硝基化级别的反应
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化遮盖组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的队列。橙色标识的队列数字代表S-亚硝基化肽,颜色标识的C数字代表S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱分析
04.S-亚硝基化Caspase-3可降解结淀粉酶
结血清看做是一种极为比较重要的组织组织骨架血清,在保持肌组织组织框架的框架全部性和收縮性管理方面起着极为比较重要帮助,分析S-亚硝基化caspase-3对结血清分解的比较敏理性拥有极为比较重要实际意义。与Std(未用胱天血清酶-3和GSNO孵育的初始状态肌弹性化学纤维血清)组不同之处,0 μM GSNO组(肌原弹性化学纤维和caspase-3的孵育,无GSNO)的全部结血清含铁显著性减轻,提示信息caspase-3对结血清拥有潜在性的血清水解反应工作能力。在GSNO孵育后,全部结血清的含铁分明上升(P < 0.05)。虽然,当GSNO氧浓度变高时,全部结血清的含铁持续保持调整(P < 0.05)(图5)。一项察觉到反映,SNO呈现的caspase-3以水平面依赖感的途径控制结血清的分解。
图5.S-亚硝基化caspase-3光降解结蛋清
05.S-亚硝基化Caspase- 3吸附肌钙蛋白酶-T
肌钙蛋清-T (TnT)是原肌球蛋清调结管理肌肉组织拉伸的细条的所需肌原仟维蛋清。TnT的吸附表现形式是测试到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化前提下,caspase-3对TnT的吸附现状如下图所示6如下图所示,与Std组(含有caspase-3和GSNO的肌原仟维)相较于,caspase-3组中30 kDa TnT场面描写为特殊曾加,证实caspase-3参与性了TnT的吸附,除此以外,caspase-3与GSNO的孵育引致30 kDa TnT上升。在100和200 μM GSNO组两者不存在测试到严重的对比(P > 0.05),而当GSNO的浓硫酸浓度达成400 μM 时,该场面描写为特殊减小(P < 0.05)。以上出现证实了SNO掩盖语的caspase-3对TnT吸附的自动调节做用。结蛋清和TnT是caspase-3的敏感性底物,而GSNO除理消减caspase-3的特异性已经引致肌原仟维蛋清吸附因素消减。综上经验经验,NO引发的S-亚硝基化需要在掩盖语半胱氨酸残基来调结caspase-3的特异性,随之进第一步反应其对结蛋清和TnT的蛋清淀粉水解程度,然后反应羊肉品質。
图6. S-亚硝基化caspase- 3挥发肌钙球蛋白-T
二、总结
本深入分析有何意义浅析S-亚硝基化对caspase-3淡化的以至于极其很快对羊肉肌原棉化学纤维身体溶解的以至于。核球蛋清S-亚硝基化就可以淡化caspase-3的半胱氨酸残基,为了以至于caspase-3抗逆性缩减,进每一步治理和改善了其对羊肉肌原棉化学纤维核球蛋清的核球蛋清溶解水平。三、拜谱总结ppt
深入剖析所采用了酶活校正,亚硝基化突显组学剖析,WB等检查伎俩,看到核球淀粉酶S-亚硝基化能否突显caspase-3的半胱氨酸残基,这诱发了caspase-3生物的削减,并举每一步控制了其对鸡肉肌原纤维棉核球淀粉酶的核球淀粉酶水解反应工作能力。本深入剖析为解釋核球淀粉酶质亚硝基化对吃起来的监测长效机制供给好几回个新的角度。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的淀粉酶质组学、掩盖淀粉酶质组学、细胞代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸系类厂品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺酸性反应、total被氧化恢复、游离态巯基,欢迎大家咨询!
学习文献资料:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663